工程监理费的计算方法，一般由建设单位与工程监理企业协商确定。计算方法主要有：
一、按建设工程投资的百分比计算法
就是按委托监理工程概（预）算的百分比计收工程监理费。当工程结算时，再按实际工程投资进行调整。这种方法是国家制定监理取费标准的主要形式，建设单位和工程监理企业也易接受。
二、固定价格计算法
就是建设单位与工程监理企业在协商一致的基础上形成的监理合同固定价格，实践中可进一步分为固定总价和固定单价计算法。其特点是：当实际监理工作量比计划工作量有所增减时，一般也不调整工程监理费的总价或者单价。这种方法适用于监理工作内容明确的中小型工程监理费的计算。
三、工资加一定比例的其他费用计算法
就是以项目监理机构监理人员的实际工资乘以一个大于1的系数，此系数通过综合考虑应有的其他直接费、间接成本、税金和利润来确定。由于建设单位与上程监理企业难得对监理人员数量和实际工资额达成一致，此方法较少采用。
四、按时计算法
就是按建设单位和工程监理企业双方约定的单位时间监理费，乘以约定的监理服务时间来计算工程监理费总额。单位时间监理费一般以监理人员基本工资为基础，加上适当的管理费和利润而得到。这种方法适用于临时性的、短期的监理业务，或者不宜按其他方法计算监理费的监理业务。
对于监理风险较大的建设工程，可以由几家工程监理企业组成监理联合体共同承担监理业务，以分担风险。这种情况下，各家工程监理企业还要注意事先约定适当的分配方法以明确各自应得的工程监理费。 