根据森林保护规定，在施工区域内不可破坏林木。并且在施工阶段，必须保护野生动物生活环境，禁止个人与单位非法捕猎。合理规划施工范围，不能破坏施工区外的林木，不能随意捕杀野生动物。
如果施工区域内存在珍惜植物，需要及时登记和保护，在迁移的过程中，需要根据林业部门指导，选择接近的气候、土壤、水分环境进行移栽。进行就地保护的植物，在确定不会影响工作布置的情况下，进行挂牌登记，表明植物名称、保护级别，并且对施工人员进行宣传教育。施工人员不可伤害国家保护动物，如果在施工区域发现国家保护动物，需要及时与管理部门进行沟通，采取合理的保护措施。
如果施工区域存在珍贵水生生物，在施工过程不得捕杀受保护的生物，在汛期内滞留在基坑内的鱼类，尤其是繁殖期鱼类，需要谨慎进行处理，在专业水产人员的指导下，组织当地人员捕捞放流。如果工程涉及自然保护区，需要严格遵守当地与国家制定的保护协议。
水利水电工程监理公司表示，如果建设区域内存在文物景观，需要尽量减少破坏情况，对水库建成后会淹没的历史遗址，需要选择转移保护，在水库蓄水前完成相关的考古挖掘工作，水面以上的历史建筑，需要进行加固、防腐、防震等保护措施。 